Sebagai Madrasah Unggulan, MI Ma’had Islam memberlakukan berbagai progam khusus untuk meningkatkan ciri khas sebagai madrasah unggul kepada masyarakat. Berikut beberapa progam unggulan MI Ma’had Islam Kopeng:

  1. Tilawatil Qur’an
  2. Tahfidzul Qur,an
  3. Bimbingan Baca Tulis Al-Qur,an
  4. Nadhom
  5. Pembelajaran berbasis E-Learning dan IT
  6. Istighosah & Bimbingan Tahlil (rutinan)
  7. Bimbingan membaca kitab dasar
  8. Bimbingan Ibadah (rutinan)
  9. Shalat Berjamaah (rutinan)
  10. Bimbingan Do’a (rutinan)
  11. Bimbingan Ahlak (rutinan)
  12. Sholat Dhuha & Dzuhur Berjamaah (rutinan)
  13. Fasholatan Bhs. Arab (rutinan)
  14. Pembelajaran Berbasis Agama Ahlusunnah Waljamaah
    Annahdziyah (50% berbasis agama & 50% umum)